Een bestand met de PDB-bestandsextensie is hoogstwaarschijnlijk een bestand gemaakt in het programma Database-indeling dat wordt gebruikt om foutopsporingsinformatie bij te houden over een programma of module, zoals een DLL- of EXE-bestand. Ze worden soms symboolbestanden genoemd.
PDB-bestanden brengen verschillende componenten en statements in een broncode in kaart naar het uiteindelijke gecompileerde product, dat de debugger vervolgens kan gebruiken om het bronbestand en de locatie in het uitvoerbare bestand te vinden waarop het het foutopsporingsproces zou moeten stoppen.
Sommige PDB-bestanden kunnen in plaats daarvan in de bestandsindeling Protein Data Bank staan. Deze PDB-bestanden zijn platte tekstbestanden die coördinaten opslaan met betrekking tot eiwitstructuren.
Andere PDB-bestanden zijn waarschijnlijk gemaakt in de Palm Database of het PalmDOC-bestandsformaat en worden gebruikt met het PalmOS mobiele besturingssysteem. Sommige bestanden in deze indeling gebruiken in plaats daarvan de .PRC-bestandsextensie.
Hoe een PDB-bestand te openen
Verschillende programma's gebruiken hun eigen PDB-bestand om gegevens op te slaan in een soort gestructureerde database-indeling, zodat elke toepassing wordt gebruikt om een eigen type PDB-bestand te openen. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio en Pegasus zijn slechts enkele voorbeelden van programma's die een PDB-bestand als een databasebestand kunnen gebruiken. Radare en PDBparse kunnen ook werken voor het openen van PDB-bestanden.
Sommige PDB-bestanden worden opgeslagen als platte tekst, zoals Geneious 'Program Debug Database-bestanden en zijn volledig menselijk leesbaar als ze worden geopend in een teksteditor. U kunt dit soort PDB-bestanden openen met elk programma dat tekstdocumenten kan lezen, zoals het ingebouwde Kladblok-programma in Windows. Sommige andere viewers en editors voor PDB-bestanden zijn Notepad ++ en Brackets.
Andere PDB-databasebestanden zijn geen tekstdocumenten en zijn alleen nuttig wanneer ze worden geopend met het programma waarvoor ze zijn bedoeld. Als uw PDB-bestand bijvoorbeeld op de een of andere manier verband houdt met Quicken, probeer dan die software te gebruiken om het PDB-bestand te bekijken of te bewerken. Visual Studio verwacht een PDB-bestand in dezelfde map te zien als het DLL- of EXE-bestand.
U kunt PDB-bestanden die Protein Data Bank-bestanden zijn bekijken en bewerken in Windows, Linux en macOS met Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB en USCF Chimera kunnen ook een PDB-bestand openen. Omdat deze bestanden platte tekst zijn, kunt u het PDB-bestand ook in een teksteditor openen.
Palm Desktop moet in staat zijn om PDB-bestanden te openen die zich in de Palm Database-bestandsindeling bevinden, maar u moet deze mogelijk eerst een nieuwe naam geven om de .PRC-bestandsextensie voor dat programma te hebben om deze te herkennen. Om een PalmDOC PDB-bestand te openen, probeer STDU Viewer.
Hoe een PDB-bestand te converteren
Program Database-bestanden kunnen hoogstwaarschijnlijk niet naar een ander bestandsformaat worden geconverteerd, althans niet met een gewone tool voor bestandsconversie. In plaats daarvan, als er een tool is die dit soort PDB-bestanden kan converteren, zou het hetzelfde programma zijn dat het kan openen.
Als u bijvoorbeeld uw PDB-databasebestand van Quicken wilt converteren, probeer dat programma dan te gebruiken. Dit type conversie is echter waarschijnlijk niet alleen van weinig nut maar wordt ook niet ondersteund in deze databaseapplicaties (dat wil zeggen dat u dit soort PDB-bestanden waarschijnlijk niet naar een ander formaat hoeft te converteren).
Eiwitgegevensbankbestanden kunnen met MeshLab naar andere formaten worden geconverteerd. Om dit te doen, moet u het PDB-bestand eerst converteren naar WRL met PyMOL van de Bestand> Afbeelding opslaan als> VRML menu en importeer het WRL-bestand in MeshLab en gebruik de Bestand> Mesh exporteren als menu om uiteindelijk het PDB-bestand naar STL of een ander bestandsformaat te converteren.
Als u niet wilt dat het model in kleur is, kunt u het PDB-bestand rechtstreeks naar STL exporteren met USCF Chimera (de downloadlink is hierboven). Anders kunt u dezelfde methode gebruiken als hierboven (met MeshLab) om PDB naar WRL te converteren met USCF Chimera en vervolgens het WRL-bestand naar STL te exporteren met MeshLab.
Om PDB naar PDF of EPUB te converteren, is het mogelijk om een PalmDOC-bestand op een aantal manieren te gebruiken, maar het gemakkelijkst is waarschijnlijk om een online PDB-converter zoals Zamzar te gebruiken. U kunt uw VOB-bestand uploaden naar die website om de optie te hebben deze te converteren naar die indelingen, evenals naar AZW3-, FB2-, MOBI-, PML-, PRC-, TXT- en andere eBook-bestandsindelingen.
Om het PDB-bestand naar het FASTA-formaat te converteren, kan met de online PDB-naar-FASTA-converter van Meiler Lab worden gedaan.
Het is ook mogelijk om PDB naar CIF (Crystallographic Information-formaat) online te converteren met PDBx / mmCIF.
Geavanceerd lezen van PDB-bestanden
U kunt veel meer lezen over Program Database-bestanden van Microsoft, GitHub en Wintellect.
Er is ook meer te leren over Protein Data Bank-bestanden; zie Worldwide Protein Data Bank en RCSB PDB.
Is uw bestand nog steeds niet geopend?
PDB-bestanden die niet worden geopend met een van de tools van hierboven, zijn waarschijnlijk niet echt PDB-bestanden. Wat er mogelijk aan de hand is, is dat je de bestandsextensie verkeerd interpreteert; sommige bestandsindelingen gebruiken een achtervoegsel dat sterk lijkt op ".PDB" wanneer ze echt niet gerelateerd zijn en niet hetzelfde werken.
Een PDF-bestand is bijvoorbeeld een documentbestand, maar de meeste programma's van boven zullen de tekst en / of afbeeldingen niet correct weergeven als u er een probeert te openen met deze softwareprogramma's. Hetzelfde geldt voor andere bestanden met gelijk gespelde bestandsextensies, zoals PD-, PDE-, PDC- en PDO-bestanden.
PBD is een andere die behoort tot het EaseUS Todo Backup-programma en is daarom alleen nuttig wanneer het met die software wordt geopend.
Als u geen PDB-bestand hebt, onderzoek dan de bestandsextensie die uw bestand heeft, zodat u het juiste programma kunt vinden dat wordt geopend of geconverteerd.
